Z=linkage(Y)使用最短距离算法生成具层次结构的聚类树。 

    输入矩阵Y为pdist函数输出的距离行向量。 

    Z=linkage(Y,’method’)使用由’method’指定的算法计算生成聚类树。’method’可取表中特征字符串值。 

         ’method’取值及含义 
       字符串          含  义 
    ’single’       最短距离(缺省) 
    ’complete’      最大距离 
    ’average’      平均距离 
    ’centroid’      重心距离 
    ’ward’      离差平方和方法(Ward方法)

    输出Z为包含聚类树信息的 (m-1)*3矩阵。聚类树上的叶节点为原始数据集中的对象,由1到m 。它们是单元素的类,级别更高的类都由它们生成。对应于Z中行j 每个新生成的类,其索引为 j+m ,其中m 为初始叶节点的数量。 

    第1列和第2列,即Z(i,1:2)包含了被两两连接生成一个新类的所有对象的索引。生成的新类索引为 j+m 。共 有 m-1 个级别更高的类,它们对应于聚类树中的内部节点。 

    第三列,Z(i,3)包含了相应的在类中的两两对象间的连接距离。 

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